• 外显子组测序及数据分析

外显子组测序及数据分析

 外显子组测序及数据分析专题培训班针对性极强,课程内容紧凑高效,集理论课和上机课于一体,由中科院该领域实验设计及数据分析一线科研团队讲授。日期培训内容课时第一天测序技术比较和在基因组重测序的应用全外显子组重测序技术的应用和局限全外显子组重测序的实验设全外显子组捕获技术介绍和评价全外显子重测序实验流程全外显子重测序数据合格标准数据分析准备Linux客户端的安装、配置及使用方法数据分析常用L

 外显子组测序及数据分析专题培训班针对性极强,课程内容紧凑高效,集理论课和上机课于一体,由中科院该领域实验设计及数据分析一线科研团队讲授。

日期

培训内容

课时

第一天

测序技术比较和在基因组重测序的应用

全外显子组重测序技术的应用和局限

全外显子组重测序的实验设

全外显子组捕获技术介绍和评价

全外显子重测序实验流程

全外显子重测序数据合格标准

数据分析准备

Linux客户端的安装、配置及使用方法

数据分析常用Linux命令讲解及操作

3h

第二天

全外显子组数据分析流程

测序覆盖度及深度评估

识别变异位点(Samtools,GATK)

变异位点过滤

变异位点基因注释

变异位点数据库分析(dbSNP,1000Genome, ESP外显子组数据库等)

变异位点保守性预测与致病性分析(SIFT、Polyphen-2、PhyloP、GERP scores等)

3h

    



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