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如何选择二代测序/三代测序文库?如何优化测序实验方案?如何了解并掌握测序数据分析流程?
二代测序/三代测序实验方案与数据分析精品培训班由中科院一线项目经验丰富的科研人员授课。本精品班采用微型班授课方式,每班不超过12人。课程内容针对性极强、上机实践比重更达到70%。整套课程教学目的明确,从二代测序、三代测序(单分子测序)实验方案的宏观到细节再到注意事项的讲解,为项目能产出更有效的测序数据打下坚实的基础,上机实践课程贯穿从测序数据下机后质量评估、数据筛选到基因组分析、转录组分析整个流程!
内容 | 课时 | |
1 | 二代测序、三代测序基本理论及实验方案设计
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2 | 生物信息学中的计算机技术(上机) 1. Linux在生物信息中的应用 2. 生物信息分析中常用的Linux命令
3. 生物信息分析平台的初步建立 4. 生物信息云平台介绍及使用方法 5.生物信息基本技能
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3 | NGS中的基因组分析(上机) 1. 分析工具介绍 2. 平台数据介绍 3. 基因组常规分析和深度分析 4. 全基因组/外显子组测序分析介绍 5. De novo测序分析介绍
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4 | NGS中的转录组分析(上机) 1. 分析工具介绍 2. 平台数据介绍 3. 转录组常规分析和深度分析 4. RNA-Seq测序分析介绍
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5 | R语言入门及绘图实例(上机) 1. R语言的介绍 2. R语言的程序包 3. 数据管理
4. R语言绘图 |
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