• 宏基因组学与数据分析

宏基因组学与数据分析

宏基因组学及数据分析专题培训班以二代测序/三代测序(单分子测序)在宏基因组学中的应用与数据分析为主题,精心设计了具有前沿性、实用性和针对性的理论课程和上机课程。课程由中科院一线科研人员主讲,小班授课!课程内容课时理论课宏基因组基本理论及实验方案设计内容1. 二代测序/三代测序(单分子测序)原理2. 宏基因组学研究现状及应用宏基因组研究的发展历史典型的宏基因组研究及应用两种宏基因组研究的策略宏基因组

宏基因组学及数据分析专题培训班以二代测序/三代测序(单分子测序)在宏基因组学中的应用与数据分析为主题,精心设计了具有前沿性、实用性和针对性的理论课程和上机课程。课程由中科院一线科研人员主讲,小班授课!

课程

内容

课时

理论课


宏基因组基本理论及实验方案设计内容

1. 二代测序/三代测序(单分子测序)原理

2. 宏基因组学研究现状及应用

  • 宏基因组研究的发展历史

  • 典型的宏基因组研究及应用

  • 两种宏基因组研究的策略

  • 宏基因组数据分析中的挑战

3. 宏基因组实验技术(meta DNA提取,16s扩增和文库制备、筛选策略的选择等)

4. 二代测序/三代测序(单分子测序)在宏基因组学研究中的应用

6h

上机课


1. Linux在生物信息中的应用

2. 生物信息分析中常用的Linux命令


宏基因组分析平台的构建内容:

  • 基于各种系统下的宏基因组分析平台介绍

  • 宏基因组分析平台的选择策略

  • 常规分析宏基因组的软件介绍

  • 分析宏基因组数据的必备技能

  • 构建宏基因组分析平台的工具

  • 宏基因组平台构建的策略

  • 宏基因组分析平台的维护和升级


宏基因组数据分析策略介绍内容:

  • 宏基因组数据分析流程设计

  • 宏基因组拼接组装

  • 物种组成及丰度分析

  • 物种多样性分析

  • 菌群间差异分析

  • 功能基因的预测分析

  • 代谢通路分析

6h


 



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