外显子测序发现肺癌新突变

摘要:美国和俄罗斯的研究人员对肺癌细胞进行外显子测序发现了一些新的驱动突变(driver mutations),可用于基因靶向治疗和免疫治疗。相关研究结果发表在最新一期的《Nature Genetics》杂志上。 在这项研究中,研究人员分 ......


美国和俄罗斯的研究人员对肺癌细胞进行外显子测序发现了一些新的驱动突变(driver mutations),可用于基因靶向治疗和免疫治疗。相关研究结果发表在最新一期的《Nature Genetics》杂志上。 

在这项研究中,研究人员分析了两种最常见肺癌类型——肺腺癌和肺鳞状细胞癌——的1144个基因组。这项研究具有高度统计学显著性,可让研究人员识别影响若干蛋白质(负责细胞中的信号)的新型驱动突变。 

总的来说,科学家们在肺腺癌中发现了38个显著突变的基因,在肺鳞状细胞癌中发现了20个突变的基因。然而,只有6个突变基因在这两种肿瘤之间是共享的。这表明,尽管这两种肿瘤出现在相同的器官,但是它们的区别很明显。所确定的基因突变与其他19种癌症类型对比发现,与肺腺癌相比,肺鳞状细胞癌更类似于头颈部肿瘤和一小部分膀胱癌。 

另外,在大多数的肺癌病例中,研究者还确定了几个预测的新表位(neoepitopes)——可能被免疫系统识别的蛋白质片段,并作为标记来识别和对抗癌症。47%的肺腺癌和53%的肺鳞状细胞癌样本具有至少5个预测的neoepitopes。

本文第一作者、麻省理工学院(MIT)和哈佛大学布罗德研究所的博士后Joshua Campbell指出:“我们已经确定了几个不同的复发性突变,可能会被免疫系统识别,因此将是癌症疫苗强有力的候选者。” 

以前,研究人员认为,主要的驱动突变在肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间是类似的。然而,这项新研究表明,细胞类型是一个关键因素,决定着这些突变是否导致细胞增长和不受控制地增殖。 

Campbell补充道:“未来还需要确定,是什么原因使一个基因突变导致一种类型的细胞不受控制的增长,而另一种类型的细胞不增长。这些见解将会让我们更完整地理解参与肿瘤生长的分子途径,并帮助我们设计出更好的药物。” 

研究者还估计了每种肿瘤中吸烟相关的突变,发现一小部分肺腺癌具有很少的吸烟相关突变,这种肿瘤的样本主要来自于非吸烟者。这一事实通过流行病学数据得以验证,从而支持一个想法:肺癌可能源自吸烟以外的主要因素。 

参考文献:Distinct Patterns of Somatic Genome Alterations in LungAdenocarcinomas and Squamous Cell Carcinomas. Nature Genetics, May 9, 2016;http://dx.doi.org/10.1038/ng.3564

时间:2016-5-10 18:07  来源:生物通/王英

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